Il Museo del Balì ha come scopo proritario la diffusione della cultura scientifica sul territorio sia presso il pubblico dei visitatori, sia verso gli studenti delle scuole di ogni ordine e grado. Il Museo assolve alla propria missione attraverso attività e iniziative culturali, formative, educative, informative che promuove e realizza, tra cui:

visite alla propria esposizione permanente;
spettacoli al planetario;
osservazioni ai telescopi;
progettazione ed esecuzione di attività laboratoriali didattiche;
organizzazione di mostre temporanee;
corsi di aggiornamento per docenti;
collaborazione con altri musei ed enti di ricerca per attività formative connesse a percorsi didattici nonché per la predisposizione di materiali e sussidi, anche a carattere divulgativo;
organizzazione eventi di divulgazione scientifica;
sensibilizzazione del pubblico su temi di attualità nella ricerca scientifica e su tutti gli aspetti della cultura che ben si possono coniugare con la divulgazione scientifica.